剧情故事
基于FCD版官方说明书
在前作Zelda传说1海拉尔幻想里主人公林克努力打败了魔王伽农。虽然夺回了三角力量，救出了Zelda公主，然而海拉尔却在一直荒废下去。在伽农邪恶余党影响下，诸神的大地惭惭受到侵蚀。
数年后，林克16岁了，左手护甲上突然出现了三角力纹章。Zelda的乳母印帕看到纹章，把林克引到初代Zelda公主那里，开始讲述发生在古代王家的悲剧。
很久以前，海拉尔王家把勇气三角力封印了，与对待力量三角力、智慧三角力的态度截然不同。初代Zelda公主坚决反对这样做。为了实现这个目的，王兄身边的大魔导师『カロック(Karokku)』对初代Zelda公主施加了魔咒，公主入睡后，再也不会醒来。后来王兄意识到了自己的错误，与世长辞前留下规戒，要求历代的公主皆以Zelda命名。
印帕告诉林克，有了勇气三角力，就能唤醒初代Zelda公主，左手护甲上的纹章证明林克可以继承三角力。林克为了获得勇气三角力，决定再次踏上旅途。同时，群魔在搞魔王伽农的复活仪式，正在积极活行中，仪式必须有“杀伽农者之血”，也就是林克的血，群魔为了获得林克的血，争先恐后地在林克的必经之路上埋伏布阵，等着林克献血。
基于WII-VC版官方说明书
在前作Zelda传说1海拉尔幻想里，激斗之末，主人公林克打倒了魔王伽农。救出了Zelda公主。
可是，打倒伽农之后，海拉尔在伽农残存的邪恶力量影响下，一直荒废了下去。
时间在流逝，林克16岁了，左手护甲上突然出现了不思议的三角力纹章，那是拥有使用三角力所必需的清心与天生素质的表现，特殊的纹章。Zelda公主的乳母印帕看到纹章，把林克引到一扇打不开的门前，林克使用手上的纹章将门打开，发现初代Zelda公主横躺在那里，印帕提到当地流传的传说，把卷物与6颗水晶交给林克。
卷物上记录着如下内容：三角力有3个，“力量”、“智慧”、“勇气”。收集齐全才能发挥出最大限度力量。
“力量”与“智慧”三角力已经到手了，“勇气”三角力被王封印了，要想入手，6颗水晶非常必要……
印帕恳求道：“三角力肯定能解除施加在初代Zelda公主身上的魔法。救救公主吧，这样就能把海拉尔的和平生活恢复过来。”
林克无言，只是点头同意，朝初代Zelda公主所在方向望了一眼，离开了房间。于是，林克拿上剑与盾，踏上了单人旅途。
此时的另一方，伽农的手下们，正在寻找机会让伽农复活。
“勇气”三角力隐藏在『死の谷（デス・バレー）』的大神殿。为了进入大神殿，林克必须逐个打倒海拉尔6神殿里的6位守护神，把水晶嵌入神像，这样才能打开最终大神殿的结界。